佐科威表示，南海必須成為和平與穩定的地區。國際法應得到尊重，並應防止大國在南海地區的敵對行動。
他指出，雖然印尼並非南海主權聲索國，但印尼持續通過各種方式促使爭端各方建立互信，其中包括邀請所有利益相關方定期舉行管控南海潛在衝突的研討會。
印尼過往自許為南海爭議調停者，佐科威也曾表示，亞太區維持政治上的穩定及安全對印尼的經濟成長相當重要，印尼支持南海行為準則，也支持中國大陸和日本及東協成員對話，解決爭議。
值得注意的是，印尼納土那群島（Natuna）位於南海、靠近中國大陸主張有領土主權的海域。大陸的南海九段線納入納土那群島部分地區，引發印尼抗議。
印尼計劃在納土那群島建設新的軍事基地、部署戰機。印尼並指中國大陸九段線與納土那群島周圍200浬專屬經濟區重疊，呼籲大陸變更九段線範圍。
印尼軍方則加強軍力，駐守納土那群島，並規劃部署蘇愷27和蘇愷30戰機。