前總統李登輝在新書中談到「釣魚台列嶼不歸屬台灣」，並表示，前行政院長游錫堃把釣魚台列入宜蘭縣頭城鎮管轄，「再也沒有比這更愚蠢的事了」！對此，游錫堃16日在臉書上po文駁斥說，「我最早知道『釣魚台是中華民國領土』是聽李登輝先生說的，」並進一步附上政府公文指出，「把釣魚台列入宜蘭縣頭城鎮管轄，並非在他院長任內」。
李登輝出版新書《餘生：我的生命之旅與台灣民主之路》中指出，「釣魚台列嶼不歸屬台灣，這是毋庸置疑的事實」。他還說，2000年民進黨執政後，游錫堃把釣魚台列入宜蘭縣頭城鎮管轄，「再也沒有比這更愚蠢的事了」！
對此，游錫堃表示，他最早知道「釣魚台是中華民國領土」是聽李登輝說的，當時他擔任省議員，李登輝擔任台灣省政府主席。
游錫堃說，1991年，高雄市吳敦義市長（時任國民黨中常委）辦理全國運動會，公開宣示要將聖火傳遞到釣魚台，並指派高雄市政府秘書長林中森率隊搭船前往，引起台日兩國關係緊張，最後雖未傳遞成功，但該行動可證明李登輝政府仍然認為釣魚台是中華民國領土。
游錫堃指出，事實上將釣魚台列入宜蘭縣行政轄區，是1973年台灣省政府62.4.26府民一字第39989號函轉行政院62.4.9台六十二內字第3046號函辦理，並非在他行政院長任內。