市議會預計自19日起召開臨時會，應民意要求，瞭解市府0206災後重建善後相關措施。民進黨團總召郭國文等人認為臨時會召開時間急迫，16日當面建議李議長延期召開，李議長同意於程委會一併討論。
市議會民進黨團總召郭國文與邱莉莉、李退之、呂維胤等議員認為，市議會此時召開臨時會其實於事無補，只會讓市府的後續工作綁手綁腳而已。
他們指出，議長李全教提到關於掌握各區受災資料、向社會大眾說明重建、安置、心理輔導等措施與具體說法等等，其實可以直接跟市府建議即可，根本不需召開臨時會。而另外關於救災善款之監督，目前市府也會成立委員會來監督，透過議會臨時會監督反而耗時。而關於第二預備金之動用，其實在去年底預算已過的情況下，已是市府的裁量權。因此他們希望李全教能三思而後行，暫緩召開臨時會
李全教則表示，議會是合議制，議會不開會期間幾乎無法發揮功能，而是透過個別議員各自動作，臺南市發生此重大事件，市府各界救災相當辛苦，值得肯定。然而以去年登革熱嚴重疫情為例，大多數人事後檢討皆認為，如果去年登革熱疫情一暴發時，當時市府官員肯進來議會開會接受議員意見，讓里長依往例進行噴藥等防疫，相信去年登革熱疫情不會如此嚴重。
同樣，面對災難發生，大家都盡最大力量提供即時協助，當救災告一段落，接著下來就是災後重建工作，臺南市議會應發揮市議會功能，連遠在臺北的立法院都訂在19日開始開會，討論是否撥專款協助災區重建，若此節骨眼，臺南市議會反而置身事外，不討論、不參與、不關心的話，豈不有負選民所託，且社會各界包括國民黨團、無黨聯盟都期待，議會應該表達對此次災難的關心與協助，因此據以召開臨時會。
李全教說，若此時尚在救災階段，召開臨時會確實不適合，但救災已告一段落，目前多屬善後接受百姓陳情與勘災，而據他每天實際出入永康、仁德、玉井等災區勘查結果，市府往往均由業務人員配合勘災。臨時會僅幾天議程，官員如果真的有事，可以向議會請假，議會未曾不准過假。