南台強震導致台南市、高雄市及嘉義縣有許多學校出現玻璃破損、天花板或磁磚掉落等情況，教育部在中央災害應變中心工作會報中表示，這次共有數百間學校受災，所幸都不影響下週正常開學。
中央災害應變中心指揮官、內政部長陳威仁指示教育部督促地方教育局處加強注意開學後的校園安全問題。陳威仁：『(原音)有一些傾斜、可能有一些掉落物的，這些應該要怎麼樣做一些隔離，避免學生安全受到影響，這部分請教育部屆時來做好。』
陳威仁也指出，天氣穩定有助於救災，希望能有更多奇蹟出現，現階段台南市政府已啟動「大鋼牙」計畫，他建議消防署聯絡台南市政府，提出在救援現場除了機械作業手外，也應加派守望員，以隨時留意是否有受困人員在瓦礫堆中出現。
另外，陳威仁也指示警政署蒐集當天地震發生前後受損房屋附近的監視器影像，以供國家災害防救科技中心未來進一步分析這次地震災情。