馬英九總統9日再度到中央災害應變中心關心救災進度。總統表示，這兩天他到台南看到當地的情況，真的非常不捨，尤其看到生還者李宗典兩個罹難的姪女緊緊抱在一起，讓他想到自己也有兩個女兒，如果這件事情發生在自己身上，會是什麼感受，所以他非常能夠感同身受。總統呼籲各界多給災區關懷，為他們打氣。馬英九：『(原音)我們希望民眾都能夠踴躍的表達對於災區的關懷、對於往生者表達悼念之意，對於還在爭取救援的，我們要給他們打氣。』
馬總統也提到，台南市長賴清德從震災發生後就不眠不休，至今已經4天，他很感謝，也相當不捨，但身為父母官，必須因應各方面的要求，很難放鬆。總統並表示，17年前921大地震，他處理東星大樓倒塌事件時，那10天的煎熬是他永難忘懷的經驗，所以他完全能體會賴清德現在的感受，他會完全支持賴清德，並與他一起度過最困難的時間。