飛安會執行長王興中指出，GE222復航澎湖空難事故與可能肇因有關的調查發現共有10項，其中9項與飛航操作有關，1項與天氣有關。
事故發生當天颱風麥德姆剛通過台灣，天候不佳，造成飛機降落不順利，通過誤失進場點，兩位飛航組員並沒有遵照標準作業程序，加上降雨激烈，事故發生當下視線能見度極差，飛機飛行到高度72呎時駕駛決定重飛，但已太遲。
飛安會表示，此事故的正駕駛對自身飛行技術過度自信，副駕駛也未提出質疑，加上過勞導致工作表現下降，因此釀禍，指出復興航空的風險管理程序及評估不當。
基於此調查發現，飛安會建議復航要執行有效的安全措施，也建議民航局應該建一套更健全的監理流程機制。飛安會也指出，民航局提供檢查員指引也還有須強化的地方，對於如何認定航空公司的風險，還欠缺一套更有效的管理標準。