市府將自30日起啟動今年的登革熱防疫工作，市長賴清德27日表示，將結合全市37個行政區、轄區內的工業區、民間團體、企業共同誓師，並展開防疫清潔日的清除孳生源與巡倒刷清等登革熱防疫基本功，並動員人力查報空地、空屋與資源回收戶，讓台南市的整體環境獲得改善，並清除病媒蚊孳生源。
賴市長指示所屬，新的防疫策略必然是去年檢討後的反省與策進作為，請市府各局處及各區公所全體同仁都應擔負起防疫工作的領航員，內化為日常生活與工作的一部分，並傳給週遭的市民，因為登革熱是環境傳染病，「自己家園自己清」是不變的唯一法門，請發揮各位同仁的影響力，讓防疫力量具有加乘的效果。
賴市長也提出4個加強防疫重點：1、務必落實空地空屋的查報工作，並將其轉化為公益使用，避免疫情發生後再行查報。去年查報的空地、空屋應繼續管理和應用，累積防治效果；2、加強鄰里長、里民的教育宣導和動員；3、檢討醫療系統。檢討去年的醫療防疫經驗，作為今年的準備；4、盡可能掌握台南市民出入東南亞，或東南亞到台南市的人員，研擬相關的作為和辦法，進行管理或篩檢，並於今年防疫時啟用。