總統府發布新聞稿表示同意行政院長毛治國請辭，並由行政院副院長張善政接任閣揆。張善政25日下午表示，在民進黨表明不願意組閣後，馬英九總統於25日下午告知他自2月1日起接任閣揆。張善政說：『(原音)總統從這個週末開始就積極地規劃我們內閣這邊要重新指派一位院長，因為毛院長先前已經表達非常清楚，說他沒有留任意願。大概今天中午1、2時我進府裡面，總統親自告知我從2月1日接任行政院長。』
張善政表示，大部分閣員原則上留任，但仍有部分閣員異動，包括現任國發會主委杜紫軍將接任行政院副院長、國發會主委一職則由原陸委會副主委林祖嘉接任，並兼任政務委員。另外，農委會主委陳保基和政務委員顏鴻森因借調期滿，將回校任教，將由農委會副主委陳志清、科技會報辦公室執行秘書鐘嘉德分別接任；金管會主委曾銘宗當選國民黨不分區立委，主委一職也將由金管會副主委王儷玲接任。至於另一名政務委員葉欣誠將返回學界，遺缺則尚未找到接任人選。
張善政表示，原本內閣團隊對於是否留任有疑慮，但是在民進黨表示不會在新國會刻意為難行政團隊，以及看守內閣仍要繼續推動政務之後，原本不想留守的疑慮已經消除。他說：『(原音)民進黨已經表示說在國會不會刻意為難閣員；第二點，馬總統也好，其實我們剛也講這4個月該做的事情要做好。』
確定接任閣揆之後，張善政立即召集內閣成員開會，訂出與新政府交接的時程與計畫。他強調，看守內閣仍要做該做的事，並會在未來4個月誠意與新政府完整交接。