高鐵工會不滿公司積欠新台幣5億元加班費，日前揚言將於春節期間「正常休假」，嚴重衝擊即將來臨的春節疏運。
對此，交通部長陳建宇20日受訪表示，工會替自己的會員爭取權益是天經地義的事，但應依法並合乎情理，不能片面主張自己的要求都是對的，進而關閉協商大門。事實上，台灣高鐵公司已在日前董事會上提列5億元預備金，準備當訴訟結果出爐後、做為償還加班費之用，足已展現高鐵公司的善意及誠意。
由於爭議的焦點是加班費，陳建宇呼籲高鐵工會，把加班費的爭議和疏運脫鉤處理，以免有負「交通人的天職」，不要讓台灣高鐵在國際間建立起的良好形象毀於一旦。陳建宇說：『(原音)加班費的問題需要一點時間、一點空間去處理，理論上來講，不應該把它跟「交通人的天職」、疏運的這一塊扯在一起。所以，高鐵好不容易在國際上建立的這種形象、績效良好的形象，我真的非常誠懇地建議工會慎重考量，畢竟在這樣的情形之下，會讓國人對他們的天職、他們應該要盡的義務，產生負面的思考。』
針對高鐵公司堅持要等訴訟結果出爐，再償還加班費；陳建宇也要求高鐵局敦促高鐵公司重新思考有沒有其他更好的方法，讓雙方都能坐下來談。此外，陳建宇也已情商勞動部居間斡旋，希望可以讓勞資爭議早日落幕。
不過為了預防萬一，交通部也將組成專案小組，協調公路總局及台灣鐵路管理局擬好備案，增加疏運配套因應，以化解可能的危機。