雖然台灣高鐵表示，只要法院判決公司應補發加班費，該還給員工的一定會還。不過，高鐵工會不滿公司一再拖延，並表示如果22日前公司還未就償還加班費一事有肯定時間表，工會就會對外宣告2月起依法正常休假，不再加班。
台灣高鐵勞資雙方針對積欠加班費一事，協商多時，高鐵公司認為，從營運以來，員工出勤、休假及加班費給付，都是依「勞資會議」決議，也符勞基法。
不過，高鐵工會對雙週變形工時的加班費計算標準，及國定假日經調移休假後正常出勤，與公司有不同意見，估計公司積欠員工的加班費至少新台幣5億元。
勞動主管機關認定台灣高鐵應給付積欠員工的加班費，台灣高鐵仍認為有疑義並提請訴訟，盼釐清爭議。
不過，台灣高鐵已在11日提報董事會通過提列準備金，並著手精算每位員工可能應補足的加班費金額，預做準備。
台灣高鐵也在13日向工會表達，今年春節期間所有出勤員工，將從優給付薪資，包括調高「春節補助」金額，感謝第一線同仁春節期間辛勞付出與奉獻，也呼籲員工，不應犧牲旅客權益，一切以春節疏運為重。