該局進一步解釋，統一發票係實施商業會計法之營利事業據以登帳之憑證，營利事業銷售貨物或勞務，如未依規定開立統一發票，依經驗法則判斷，除構成逃漏營業稅外，因無憑證可據以登帳，其帳載營業收入將有短漏之情形，營利事業所得稅結算申報營業收入亦將隨之短漏，即營利事業未依規定開立統一發票，通常亦將構成逃漏營利事業所得稅，兩者間有牽連關係存在。又營利事業所得稅屬「未列選之查帳案件及擴大書面審核案件」者，始適用「以函查日（即發文日）為調查基準日」；若屬「其他涉嫌漏稅案件」，應以「進行調查之作為有數個時，以最先作為之日為調查基準日」，則本件該局以營業稅經辦人員最先進行函查之日，作為甲公司營利事業所得稅之調查基準日，並無不合。 該局特別提醒，稅捐稽徵法第48條之1規定所稱之「補報並補繳所漏稅款」，乃指於調查基準日前向主管稽徵機關申報並繳納，以鼓勵自新及節省稽徵成本，納稅義務人不得不慎，以免遭罰。