行政院長毛治國稍早發布聲明，表示選舉已經結束，新的民意已經產生，立法院新的多數黨也已經出現。由於從現在開始到5月20日新任總統上任，有長達4個月的過渡期，為了避免在當前全球政經情勢極為嚴峻的關鍵時刻，國家卻因政黨輪替，致使行政院無法進行重大決策，而嚴重影響國家發展與全民福祉，因此，他已向總統請辭，不接受慰留。
毛治國表示，將依循憲政慣例於最短時間內率領內閣完成總辭程序，以便總統得於立院開議前，按照中華民國國憲法雙首長制精神，安排立法院多數黨組閣事宜，以期國家行政工作及早步入常軌。
毛治國指出，新的國會多數黨已經產生，根據民主與責任政治的精神，已經有更好及更應該作的選擇：務必利用這個機會，建立由國會多數黨組閣的憲政慣例。「唯有這樣，國家是幸、民主政治是幸。」