台南市去年5月爆發登革熱疫情，截至1月12日，全市病例數累計2萬2761例。去年12月23日、25日、28日、30日、31日，及今年1月3日、7日、9日、10日、11日、12日單日病例數掛零。
全市各行政區登革熱病例數統計，以北區5737例居冠，其次是南區3508例、中西區3497例、東區3138例、永康區2675例、安南區1845例、安平區925例、仁德區300例、歸仁區208例、新化區152例、新營區110例。
全市37個行政區中，僅北門區未被波及，但隨著疫情大幅降溫，24個行政區疫情解除，包括大內區、柳營區、白河區、左鎮區、山上區、楠西區、鹽水區、六甲區、官田區、玉井區、佳里區、學甲區、將軍區、後壁區、龍崎區、麻豆區、下營區、南化區、新市區、新化區、善化區、安定區、中西區、安平區。
台南去年5月21日出現首例本土性登革熱病例，疫情迅速擴散，9月及10月疫情最嚴重，9月24日單日病例數高達709例，創下全年新高。台南市長賴清德1月4日已公佈今年的登革熱防治策略。