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Macrogen部署Edico Genome的多台DRAGEN處理器

美通社/ 2016.01.12 00:00
韓國首爾和聖地牙哥2016年1月11日電 /美通社/ -- 全球基因組測序服務的領導者 Macrogen

?和 Edico Genome 今天宣佈,Macrogen 選擇採用多台DRAGEN? Bio-IT處理器

,旨在加強其面向大規模基因組分析和臨床測序服務的大數據處理與分析能力。Macrogen

擁有世界級的新一代測序(NGS)設備,它們配備了 Illumina的HiSeq? X Ten、HiSeq 2000、HiSeq 2500、HiSeq

4000和MiSeq? 測序系統;Thermo Fisher 的 Ion PGM? 與 Ion Proton? 系統;Roche 的 GS-FLX 系統;以及

PacBio 儀器。Macrogen 的 IT 基礎設施容量突破了11拍字節存儲空間和3000多個核心集群。在採用 DRAGEN 之後,Macrogen

僅需26分鐘,即可分析由其 HiSeq X Ten 測序系統生成的每個基因組(30倍覆蓋),同時保持較高敏感度和特異性。這種分析包括從該測序儀器生成的文件格式

BCL 轉化為 variant call format (VCF)(變異識別格式)。

圖標:http://photos.prnewswire.com/prnh/20140716/127788

Macrogen 可提供各種基因組分析服務,包括基於 HiSeq X Ten 平臺的大規模全人類基因組測序服務,也被稱為 X-Genome

(Xpressway to Genome)。作為 Macrogen 旗下子公司,Macrogen Corp (USA)目前依託其 CLIA

認證的臨床實驗室,為醫生和病人提供基於臨床測序的醫療服務。此外,Macrogen正在計劃推出一項醫療信息與內容業務,而該業務將採用從 Asian Genome

Project(亞洲人基因計劃)及其全球基因組網絡所獲取的基因組大數據。

Macrogen 主席兼創辦人 Jeong-Sun Seo 博士表示:「在我們依託一系列 NGS 平臺,具備每天生成500多千兆字節的 NGS

數據的能力同時,加快這種大數據的分析使我們能以最大容量經營 NGS 設施並進一步提升客戶滿意度。在對多個數據分析選擇進行評估之後,我們認為 DRAGEN

具備節省大量時間的能力,同時可同步降低基礎設施成本並保持較高精確性,這將成為努力推進個性化藥物與基因組研究的客戶的最佳解決方案。」

DRAGEN 是全球首款專門用於分析 NGS 數據的處理器。該處理器在 PCIe 卡上集成,可安裝在預配置服務器上,從而無縫化整合至生物信息工作流程。

Edico Genome 行政總裁 Pieter van Rooyen

?哲學博士則表示:「作為全球最大的測序中心之一和首家提供1000美元基因組服務的商業化機構,Macrogen是基因組學方面的真正領導者並不斷為其客戶提供最為尖端的技術。DRAGEN

可專門用於處理由高吞吐量測序儀器生成的大數據,它處理時間快,具有成本效益並且精確度高。我們期待與Macrogen共同在多個中心部署 DRAGEN,並且將

Bio-IT 處理器的各種好處提供給全球17000多位客戶。」

DRAGEN 近期採用全基因組測序,以創紀錄的26個小時完成了對重症新生兒的分析,同時敏感度和特異性達99.5%,其成果發表在《Genome

Medicine 》上。自此之後,DRAGEN 的 Genome

Pipeline 可以進一步加速分析全基因組,從 BCL 到 VCF 僅需26分鐘。

DRAGEN 採用了現場可編程門陣列(FPGA),具有高度的可重組性,能夠以加速硬件的方式部署基因組系列算法,例如 BCL

轉化、壓縮、繪圖、調整、分類、重複標示和單體變異提醒。這種靈活的DRAGEN 平臺使 Edico

能開發定制化算法,以及改善並提升現有系列算法。如欲獲取升級版,客戶僅需遠程下載即可。

Macrogen 簡介

Macrogen, Inc.(網址:http://www.macrogen.com

)總部位於韓國首爾,它是全球領先的高品質基因分析服務提供商,自1997年以來取得了穩定且穩步的發展。該公司的多樣化服務包括

DNA(脫氧核糖核酸)測序、新一代測序、微陣列分析、寡核?酸合成和基因工程小鼠服務。此外,Macrogen

一直將其業務範圍拓展至分子診斷與消費者基因組等其它領域。依託全球性業務,Macrogen

以位於洛克維爾、紐約和坎布里奇的美國子公司,位於歐洲荷蘭的子公司,以及位於日本東京的子公司開展經營活動。Macrogen 在韓國高斯達克市場(Korea

Securities Dealers Automated Quotation)上市(股票代碼為:A038290)。

Edico Genome 簡介

Edico Genome 開發了全球首款專門用於分析新一代測序數據的生物信息處理器 DRAGEN?

。新一代測序的使用正以空前的速度發展,從而帶來了對可以快速且準確地處理這種大數據的技術需求。Edico

Genome的運算平臺已經表明可將全基因組數據分析由數小時縮短至數分鐘完成,同時保持較高精確性並降低費用,從而使臨床醫生和研究者能更加快速揭示答案。詳情請瀏覽:

http://www.EdicoGenome.com ,或者關注:@EdicoGenome。

消息來源 Edico Genome

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