經濟部工業局局長吳明機6日率隊前往中國大陸北京，為貨貿協議展開技術性諮商。此舉引發民進黨立法院黨團質疑，他們呼籲等新民意產生後再進行相關談判；不過，國民黨中央政策會執行長賴士葆表示，新政府要到5月20日才交接，他肯定行政團隊持續為國家打拚經濟，沒有因為選舉而放假。賴士葆也要民進黨總統候選人蔡英文對「貨貿」議題明確表態。
經濟部長鄧振中6日出席國民黨立院黨團記者會後受訪表示，之所以敲定6日展開諮商，完全是雙方時間都能配合，絕無黑箱。鄧振中說：『(原音)這協商是昨天經過雙方聯絡後，敲定大家時間都是在今天比較方便，就趕緊去聯絡機位，後來也趕緊安排機位，也都安排出來，所以在昨天傍晚把整個事情確定就立刻跟外界報告。』
鄧振中指出，目前雙方都是技術性質的協商，且貨貿協議對台灣的就業環境很有幫助，經濟部不希望因為選舉就放慢時程。鄧振中說：『(原音)這是個產業需求、對台灣未來就業很重要的事情，不要停止，如果因為這事情就慢下來、停止下來，好像這事情哪裡有問題，整個事情沒有問題，事情在於說我們有沒有爭取到我們要的東西。』
鄧振中指出，在「馬習會」後，已清楚感受到雙方都希望促成相關協議的正面氣氛，但氣氛跟談判內容是兩回事，經濟部希望能在面板、工具機、石化與汽車零組件等4大產業上爭取降稅，並為中小企業爭取更多降稅空間。他強調，經濟部會對細節嚴格把關，保障台灣產業的權益。