針對昨(4)日自由時報刊載臺灣農業產學聯盟理事長吳明敏投書「請問朱立倫開放美豬的真正立場」乙節，文中論及諸多農業議題及現象，所敘有關農產品價值滑落、農業技術品種外流、不重視產銷履歷及有機農業、動植物防檢疫未把關等，均與實際情況有所出入，農委會對此嚴正表示，政府現階段推動農業政策，以創新加值為目標，積極推動地產地消、糧食安全、強化農產品安全管理，以促進臺灣農業永續發展，該文內容有諸多不實，該會特予澄清以正視聽。
農業產值、出口、農家所得及糧食自給率均明顯提升，確保糧食安全
農委會說明，2007年至2014年國內農業產值由3,891億元提高至5,210億元，增加1,319億元，增幅達34%，並無所謂「國內農產品市場價值大幅滑落」現象，又農家所得於2014年首度超過百萬元(達102萬元)；同時期，糧食自給率明顯提升3.8%，此係遵循國際間慣例以熱量為計算糧食自給率基礎，用以確保國內糧食安全，。
我國加入WTO後，在政府加強農產品外銷措施下，臺灣農產品出口雖逐年增加，由2007年34.3億美元，增加到2014年52.6億美元，但因大宗飼料穀物進口需求量大價格漲，導致我農產貿易逆差不易大幅縮小；該會將加強辦理國外拓銷計畫，並推動國內種植進口替代作物，以減少農產貿易逆差。
農委會表示，臺灣與中國大陸自開放貿易以來，受惠兩岸2005年開始逐步推動農業貿易互動政策，包括：部分臺灣水果出口中國大陸零關稅、石斑魚活魚搬運船直航中國大陸15個港口、兩岸直航等，2013年兩岸由貿易逆差轉為順差0.17億美元，2014年順差為0.3億美元。
農委會指出，該會自2007年起依據「農產品生產及驗證管理法」實施產銷履歷驗證制度，並有嚴謹認驗證把關。推動迄2015年12月底止，產銷履歷驗證有效家數達1,570家，較2007年底310家成長逾4倍；2015年每月生產525萬份以上產銷履歷農產品，較2007年每月平均7萬份成長74倍；另2013年起推動之產銷履歷專櫃及溯源餐廳，至2015年已分別達專櫃392處、溯源餐廳181門市，產銷履歷政策持續擴大推動。
為擴大溯源農產品範圍，農委會依糧食管理法要求糧食輸入及加工業者記錄供應來源與流向，及推動自願性CAS、有機農產品驗證制度、吉園圃標章、國產牛肉生產追溯制度、臺灣農產品生產追溯制度、及104年9月1日起推動散裝雞蛋溯源標示制度等，以多元方式提供農產品溯源功能，確保消費者權益。
農業技術升級永不間斷，技術及品種保護機制化
農委會表示，農業科技升級是產業升級之重要關鍵，該會重視國內研發之各種農業技術、優良品種及研發人才，農委會為積極保護臺灣農業敏感技術，將之列為應強力防止外流中國大陸之重點項目，另對農業品種、技術及人員輸出也有相關管理措施。2000年兩岸簽署「海峽兩岸智慧財產權保護合作協議」，將農業品種權透過兩岸植物品種權工作組協商，促成陸方將蝴蝶蘭、芒果、枇杷、棗納入保護名錄，將我國農業技術及品種保護機制化。
落實動植物防疫檢疫與檢驗，確實把關國人健康另所稱「2008年9月馬政府將帶骨牛肉、牛絞肉、加工肉品、牛雜、腦和脊髓，全部列為開放項目」並非完全正確。農委會說明，目前頭骨、腦、眼睛、脊髓、絞肉及內臟等牛肉產品，因受「食品安全衛生管理法」限制，尚不得開放。且政府為保障消費者食用信心及選購權益，含牛肉或牛可食部位為原料之包裝食品、散裝食品或直接供應含牛肉餐食的飲食場所等，自101年9月起都需要明顯標示「牛肉原料原產地（國）」，供民眾清楚辨認，及作為消費選擇。
另外，近年政府口蹄疫防疫工作有成，農委會於2015年10月16日向世界動物衛生組織（OIE）申請認定臺灣本島、澎湖縣及連江縣為施打疫苗之口蹄疫非疫區。臺灣雖於2015年1月發現新型禽流感案例，但即時啟動多項監控及防疫措施，配合產業自主落實各項生物安全工作，疫情已趨緩和。
對於開放萊克多巴胺的豬肉一節，該會強調，唯有尊重食品衛生安全的專業評估，並考量臺灣養豬產業的發展與農民利益及國人消費習性，才是處理含萊劑豬肉議題的正確態度與做法。
委會強調，未來的農業必須以跨域加值與創新思維，進行產業及人、地、水資源結構調整；並擴大農業科技創新，將科技產業化，打造年輕、高競爭力及所得穩定之樂活農業。該會也已推動地產地消、加強食農教育與溝通、開創特色型產業、引進青年農民、推動農業食品雲，強化農產品安全管理等納入施政方針，期望能讓臺灣農業繼續深根發展。