澎湖文化局表示，「澎湖化石館」是由文化園區內科學館重新活化轉型，將自然科學做深入淺出的介紹，將歷年出土徵集的化石文物，有系統地展陳，使國內外民眾了解澎湖自然史的重要地位。
澎湖文化局表示，澎湖化石館首次開展，包括有「怪物石代」澎湖水道動物群特展、「石破天鯨」吉貝長鬚鯨骨骼標本常設展，「史前巨鱷」潘氏澎湖鱷常設展，極具文化考古等價值，工作人員正加緊趕工佈展，以便如期開展。
化石館開館當天，前100名全程參與開幕活動民眾可獲精美紀念品1份。另外，「澎湖水道古生物科普插圖」明信片組，分別有古菱齒象、德氏水牛及四不像鹿等11張插圖，明年1月1日起開賣，每份售價新台幣60元，參與開幕式觀眾可免費獲贈，送完為止。
澎湖化石館未來在每周三至周日上午9時至12時、下午2時至5時固定開館，國定假日及宣布停止上班日休館。