南科為因應新世代製程及產業特性調整需水量及用電量，上述水電已獲相關主管機關同意供應，刻正依據環境影響評估規定，提出環境影響差異分析報告送環保署審查中。南科管理局指出，本次變更經重新檢核後，除下修部分空氣污染物排放總量，並承諾加嚴放流水標準，且執行整體有關節能計畫與抵換措施；另外，台南園區已於97年辦理健康風險評估工作，目前正進行第二次健康風險追蹤評估中，基於環境風險管理精神，南科後續將定期辦理健康風險追蹤。
南科管理局指出，有關增加用水量5萬噸部分，短中期將暫時移用嘉南農田水利會加強灌溉管理後所節餘之農業用水，故不會對既有農作灌溉用水造成排擠，亦不會影響現有農民耕作權益；另為環境友善及善用水資源，且縮短調用農水之時間，台南園區亦已規劃於109年使用3萬噸之再生水逐步取代增量調用之農水。
南科管理局指出，至於本次增加用電量70萬kW部分，南科已獲台電公司同意由既設區域電網供電。另為使能源有效利用，園區亦積極提升相關節能措施，目前區內已有9座半導體及光電廠榮獲經濟部節能績優廠商，整體節電量共計約12.89億度/年，經換算後之減碳量共計約67.18 萬公噸CO2/年。
南科管理局指出，基於環境風險管理精神，台南園區已辦理健康風險評估工作，調查結果致癌風險為可接受等級，目前正進行第二次健康風險追蹤評估中，未來南科將定期辦理健康風險追蹤及相關說明，並在園區廠商及鄰近鄉鎮居民的共同努力及對環境承諾與監督下，讓園區成為一處永續生態社區。