三讀條文參考行政院頒訂的公款支付時限及處理應行注意事項規定，增訂政府機關辦理工程採購的付款及審核程序。政府採購案要求定期估驗或分階段付款者，政府機關應在廠商提出估驗或階段完成證明後，在15個工作天內完成審核程序，並在接到請款單後15個工作天內付款。
此外，修法也擴大履約爭議時，廠商提出強制仲裁的適用範圍。現行法規定，工程採購案在申訴委員會調解不成時，廠商可以提付仲裁，政府機關不得拒絕。三讀條文擴大適用範圍，納入勞務採購中的「技術服務採購」。未來工程採購和技術服務採購申請調解時，審議委員會必須提出調解建議或調解方案，如果政府機關不同意，廠商提付仲裁，政府機關不得拒絕。