動物園指出，園內共照養超過350種物種、逾2500隻活體動物，每年約可蒐集750公噸動物糞便，相當於250頭大象重量，原委託清運銷毀，每年約花費新台幣240萬元，且焚化爐銷毀過程也有碳排放問題，對環境造成2次汙染。
同時，除大量動物糞便外，動物每月吃剩的植物枝條也超過6000公斤。
動物園表示，為尋求更符生態與保育邏輯的經營方式，便展開「點糞成金」計畫。自民國90年底開始嘗試自行製作堆肥，但受限設備及空間而無法大量有效生產穩定的有機質堆肥。
不過，透過改善堆肥生產標準作業程序及添購碎木機具，進行堆肥的碳氮比最佳化，改善軟硬體及創新作法，約4個月的製程就能點糞成金，完熟堆肥可提供園區土壤改良，每年光是利用自行生產達300公噸的有機質堆肥，就可省下近1000萬元的經費。
另外，無尾熊更是第一群因此受惠，享用到有機桉樹的食客。動物園將自製有機堆肥栽種約2550棵桉樹，也是無尾熊「現流」新鮮食物，達到園區內產出動物排遺及植物性資材百分之百回收再利用，零有機廢棄物運出的友善做法。
動物園說，為配合北市府「田園城市政策」推動，目前有機堆肥還提供台北市各級機關學校以教學需求來函申請，同時每年也固定於3月和9月舉辦「點糞成金」親子研習營活動。