兩岸貨貿協議敲定雙方報關要在48小時內放行，引爆綠委質疑加速通關恐成緊箍咒，讓「黑心食品」有漏洞可鑽、大舉進入台灣。衛福部長蔣丙煌今（23）天在立法院答詢強調「48小時通關」純粹是針對海關作業而言，跟食安的把關基本上是兩回事，衛福部該驗的就會驗，食安檢驗完全不受限於48小時通關。
民進黨立委林淑芬質疑，兩岸談妥48小時通關，為了通關效率，卻可能降低對檢驗項目和比率的要求，恐讓黑心食品進入台灣，更何況國內海關貪腐、幣案頻傳，包庇根本是家常便飯。
林淑芬說，以衛福部現行的人力，根本不足以嚴格把關，她舉基隆關為例，評估邊境查驗人力至少需要55人才夠，但現況是正職15人、約聘18人，不但距離一大段，約聘還比正職多，一旦出事，能負什麼責任。
蔣丙煌回應時強調，未來食安把關完全不受限於48小時的要求，該抽驗就會抽驗，而該逐批檢驗的就會逐批檢驗，衛福部立場完全不受貨貿協議影響。不過，蔣也坦言，很希望人力能比現在多，已努力向行政院爭取相關的人力、預 算和資源，在此之前，會儘量在能力範圍內做好把關。