民進黨總統參選人蔡英文宣布副手搭檔為中研院前副院長陳建仁，「英仁配」成形。國民黨立院黨團17日便召開記者會，質疑陳建仁在2007年擔任國科會主委期間，涉及知名國際期刊Cancer論文抄襲。他們要求陳建仁對這篇論文負責，蔡英文也應說明清楚為何包庇陳建仁。
蔡英文17日出席補教師鐸獎頒獎典禮受訪時力挺陳建仁，她強調，這起論文抄襲爭議是源自於論文第一作者的疏忽，後來已修正並刊登。蔡英文說：『(原音)論文第一作者在處理註釋的疏忽，審查單位提出建議修改，也按照建議修改，經過嚴格審查後，刊在「Cancer」這個國際知名而且非常權威的期刊。如果這個案子涉及抄襲，這麼知名權威的國際雜誌就不會刊登它了。』
蔡英文也反批國民黨到選戰後期老是打出抹黑牌、甚至恐嚇牌，她相信選民經過2012年的宇昌案和2014年的MG149案，已經變得成熟，她也期待國民黨在選戰最後2個月能維持選舉格調。
另外，陳建仁剛出任蔡英文的副手，臉書上就開始出現陳建仁的假帳號。蔡英文說，選舉還是正大光明的好，沒必要有小動作。民進黨也強調，陳建仁目前沒有任何臉書帳號。