陸委會9日公布馬習閉門會中總統馬英九的講話全文，其中大陸對台軍武恫嚇及飛彈對台問題，馬英九稱「反對黨常常用來批評兩岸關係的口實」。民進黨總統參選人蔡英文9日回應，總統代表國家，在處理對外事務上不應該分藍綠，而軍事的問題涉及到台灣人民的生命及財產安全，更不能簡化成藍綠事務，總統這種說法讓人覺得十分失望。
根據陸委會公布的馬英九在閉門談話的內容，其中一段為「最近外界報導朱日和基地軍演還有飛彈方面的問題，這是反對黨常常用來批評兩岸關係的口實；如果有機會的話，貴方能夠採取一些有善意的具體行動，應該可以減少這一類不必要的批評。」
媒體提問本次兩岸領導人會面，是以所謂九二共識下進行，蔡英文若執政後有機會舉行「蔡習會」，是否會延續此方針。對此，蔡英文回應，她的兩岸主張向來明確，就是第一要維持台灣人民自由民主的生活方式；第二就是要維持台海的和平穩定；而兩岸交流也必須符合「對等尊嚴」、「公開透明」及「不涉及政治前提」等三項原則。
蔡英文強調，身為台灣的領導人，就應該要捍衛台灣人民擁有更多的選擇權，而非限縮台灣人的選擇權利。兩岸關係對於台灣來說是重大事務，所以處理的過程中，應該確保民主社會中的台灣人，能夠充分理解及參與，而且有做決定的機會，這是最重要的事情。