指揮中心統計，10月31日高雄市新增214例本土登革熱病例，較上週同日增加30例；台南市新增56例，較上週同日減少35例。台南市疫情已獲控制、高雄市仍處疫情高峰期。
台南市已展開「滅孑計劃」，今針對北區、中西區、安南區與安平區等17個里別再次進行化學防治，防止疫情再度攀升；高雄市10月31日已在鳳山區擴大動員清除孳生源，今將針對疫情熱區三民區擴大動員加強環境整頓，重大孳生源將開單重罰。
疫情自入夏以來，全國本土病例已達2萬9329例，其中台南市占2萬1744例、高雄市占7069例、屏東縣占144例，其餘縣市都是移入散發疫情。
目前累計死亡人數129人（台南市106例、高雄市21例、屏東縣2例），24例疑似死亡病例待審（高雄16例、台南8例），全國仍有30人於加護病房治療中。這波疫情已有2萬6999名確診病患康復，康復率達92.1%。
指揮中心提醒，受到東北季風影響南台灣氣溫稍降，但平均溫度仍適合病媒蚊孳生，民眾應持續清除孳生源，避免疫情再度攀升。