自12月1日起高鐵8個車站將增為11個車站，每周總班次從現行954班增為964班，高鐵依據尖離峰、晨間、夜間、通勤等不同時段旅運需求，規畫「直達車」(北高行車時間維持96分鐘，尖峰每小時2班次、離峰每小時1班次)、「跳蛙式列車」(包括停靠現有8站模式，尖峰每小時2班次、離峰每小時1班次)以及「站站停列車」(每小時至少1班次)3種停靠模式。
高鐵進一步說明，苗栗、彰化、雲林站加入全線營運後，每小時南下、北上各提供1班次(以往返台北站為例，新增3站平均行車時間分別為苗栗站約49分鐘、彰化站約80分鐘、雲林站約92分鐘)，部份時段提供每小時2班次列車(以往返台北站為例，平均行車時間分別為苗栗站約46分鐘、彰化站約60分鐘、雲林站約72分鐘)。
由於新站加入營運後，嘉義、台南往返台北的旅客將會增加較多的旅行時間，高鐵因此在改點於部分時段的南北雙向，增開僅停靠台北(板橋)-台中-嘉義-台南-左營的「跳蛙式列車」，台北站到嘉義站平均約76分鐘、到台南站平均約94分鐘，行車時間較現行更縮短。
同時，新時刻表也特別針對南部一早要趕赴桃園機場或北上開會洽公的旅客，將每日左營站北上首班「站站停列車」提早至6點18分發車；同時，左營、台南、嘉義等站北上的旅客，還可選擇搭乘6點24分由左營站發出的「跳蛙式列車」，更可較以往提早22分鐘抵達桃園，以及提前 6 分鐘抵達台北。