因其他縣市焚化爐歲修，一度導致雲林縣垃圾無法處理，在縣府努力下，透過「區域聯合治理」的機制，已經渡過危機，逐漸緩息，縣長李進勇感謝嘉義縣、台南市及其他縣市的協助；經過此次事件後，縣府加強違收事業廢棄物取締、縣民確實做好垃圾分類回收，已逐漸減少雲林縣每日產生的生活垃圾量，預估可以減量25%。
縣長李進勇表示，雲林縣發生垃圾危機，環保署一度袖手旁觀，還以重啟難以使用的林內焚化爐做交換條件，更加重縣內垃圾屯積問題，好在「區域聯合治理」發揮成效，其他臨近縣市陸續伸出援手，逐漸消化雲林的垃圾，但因歲修的原因，沒辦法馬上去除雲林累積的垃圾量。
依據廢棄物清理法第八條規定，因天然災害、重大事故或其他急迫之情事，致現有廢棄物貯存、回收、清除、處理設施能量不足，而有污染環境或影響人體健康之虞時，中央主管機關應會同中央目的事業主管機關及有關機關，並報請行政院核准後，得指定廢棄物緊急清理之方法、設施、處所及其期限；環保署針對此次雲林垃圾危機的處理方式與態度，明顯違失，依據廢清法中央本就應依職權協助，但遺憾環保署以焚化廠啟用綁垃圾處理。
李進勇強調，他對林內焚化爐的態度始終如一，絕無改口之說，必須三點必須釐清：第一，林內焚化爐的環評經最高行政法院判定無效；第二，達榮公司賄賂當年縣府相關官員的官司；第三，當年縣府與達榮公司簽定的不平等契約；所有的問題得解決後，才能重新思考焚化爐的處理方式，而非環保署說要啟動就啟動。
環保局代理局長張喬維也表示，雲林縣目前每天產生的生活垃圾約350噸，經過此次的危機，縣府重新檢討垃圾處理的過程，取締收取事業廢棄物、力行資源回收、垃圾分類，目標減量到280公噸，每日減少堆置量60公噸，11月初累積的垃圾，在其他縣市的幫忙下，已逐漸外運焚化。