政府極力爭取加入跨太平洋夥伴協定（TPP），行政院長毛治國陣前換將，把「國際經貿策略小組」的幕僚單位由經濟部改為國家發展委員會，並在日前發布新聞稿。
不過，媒體指出，經濟部長鄧振中為同仁在TPP的準備工作努力辯護，甚至透露國貿局長楊珍妮有辭官念頭，毛治國只好把TPP幕僚單位改回經濟部。
卓士昭下午特地澄清，楊珍妮沒有講過這些話，報導並非事實。
他說，國發會的高度適合做跨部會整合及法規調適工作，行政院「國際經貿策略小組」明天的會議會對參與 TPP的準備工作做清楚分工；至於經濟部因為有談判代表辦公室，熟稔談判作業，之前也掌握 TPP的內容，並進行對內、外溝通及市場開放的評估，上場談判還是會以經濟部為主，「我相信應該是會如此」。
卓士昭表示，行政院「國際經貿策略小組」的設置要點將增列「相關法規鬆綁及協調事項，得請國發會跨部會協調，並將結果提報專案小組」條文。