毛治國稍早在立法院答詢時表示，文化部次長以法律文件與長官溝通，不符行政倫理，造成紀律問題，不妥當。
洪孟啟說，邱于芸透過存證信函溝通，顯與部長溝通已存疑慮，且有違行政倫理，為避免文化部政策推動產生困難，已簽奉核准邱于芸免職。
文化部晚間發布新聞稿表示，近日媒體報導文化部疑以預算方式撥經費補助執政黨籍立法委員、文化部內部文書疑外洩等議題，造成外界關注、輿論質疑及立委與行政院困擾，洪孟啟深感愧歉。
洪孟啟表示，事件發生時，已立即主動交辦政風單位調查，法務部廉政署也進行處理，現已進入司法階段，全案應回歸法制面，文化部將全力配合調查，期盼事件儘速平息。
至於邱于芸以存證信函向洪孟啟表達意見，引發各界及輿論關注，洪孟啟表示，政務次長協助部長襄理文化部業務，須溝通無礙，才能齊心推動政策，為人民及國家做事。
他說，邱于芸透過存證信函方式溝通，顯然與部長溝通已存在疑慮，且有違行政倫理，他覺得遺憾。為避免文化部政策推動產生困難，經多日考慮，已簽奉核准，邱于芸已予免職。
洪孟啟表示，現階段文化部將全力著重落實藝文政策，做好文化扎根與推廣，持續推動各項重要文化事務為首要工作。期盼讓文化行政回歸本質及正軌，繼續以務實且實事求是態度，拓展文化保存與藝文發展事務。