高中英語聽力測驗上路後爭議不斷，全國教師工會總聯合會質疑其測驗公平性和費用偏高等問題，大考中心對此回應，高中英聽測驗報名費相較國內外英語檢定偏低，且經濟弱勢考生報名費有全免、減免等補助。
全教總指出，英聽測驗目前作為進入大學與否的檢定門檻，但對偏鄉、離島學生不公平，建議將英聽測驗成績由檢定改為參酌，列入學生備審資料，大學各科系也可參酌全民英檢等其他英檢成績。
大考中心回應，高中英聽報名費相較國內外英語檢定實屬偏低，為保障經濟弱勢考生的應考權利，自104學年度起由教育部補助報名費用，低收入戶考生之報名費全免，中低收入戶考生減免報名費10分之3。相較於同類型其他英文檢定報名費，高中英聽集體報名費用為350元，個別報名為380 元，實屬偏低。
大考中心也表示，經大學招生委員會聯合會決議，高中英聽測驗成績可由大學校系自訂是否列為不同管道的檢定項目，或個人申請管道審查項目之一，目前有許多學系將高中英聽列為個人申請審查項目或檢定項目。
教育部長吳思華對此表示，各校系對學生有不同選擇標準，是否要採用英聽門檻，教育部尊重各校系決定。