因指控高雄市府在發放氣爆救助金時，資源分配不均，「先發綠、再發藍」，前藍委邱毅遭高雄市長陳菊提告，高雄地院審理後，判高市府勝訴，邱毅必須在四大報刊登1日半版篇幅的道歉啟事。對此，邱毅提出五點質疑。
得知判決結果後，邱毅認為，「高雄地方法院民事庭法官王旋又成功的向陳菊遞出了投名狀。」
他指出，「在九合一選戰時，高雄市議會議長許崑源帶領數名里長到市府向陳菊抗議，氣爆善款發放不公、流向不明，有拿善款討好選民之嫌。當晚電視台以此為題進行討論，我也對之提出強烈質疑。陳菊命令高雄市政府對我提民事訴訟。經過幾個月審理，王琁法官判決高雄市政府勝訴」。
邱毅說，此判決疑點極多，他歸納成五點：
一、高雄市政府為公法人，有提出妨害名譽的訴訟權嗎？
二、我評論對象為陳菊，並非高雄市政府，陳菊非原吿，高雄市政府為訴外公法人，與本案爭議無關。
三、此評論起因是許議長到市府向陳菊抗爭引起，高市政府未告許議長，卻告評論之本人。
四、此事為可受公評之公共議題，應保障言論自由。
五、多位里長，受災戶和許議長均出庭作証，指善款發放不公。
他說，「綜合上述五點，此案判決明顯為政治操作，我強烈質疑王琁法官之動機。而陳菊在46億氣爆善款發放，敢發誓沒有黑箱操作？難道只許市長黑箱，不准社會質疑公評？」