高捷公司為呼應交通部推動多卡通政策，並讓各家票證公司持卡人在高捷系統內，均能順利使用卡片、通行無阻礙，故以「全閘門內建式多卡通」規劃依法向交通部申請補助，以改建高雄捷運電子票證中多卡通相關設備，並允諾加速建置期程，希望於105年7月提供多卡無縫通行。目前整體進度已超過20%，高捷公司已與四家票證公司(悠遊卡公司、愛金卡公司、遠鑫電子票證公司及一卡通公司)完成票卡技術與營運規則確認，並進行讀卡機韌體設計，預期104年7月，國人可持四卡之任一卡片通行高雄捷運各閘門。
在經費部分，高捷車站現有之電子票證系統屬一卡設計，為因應全面多卡通時代之功能需求，須進行設備改造及系統變更，且依電子票證管理條例、整體車站美觀及撙節經費著想由高捷整合各業者併同辦理，在交通部依法令所補助金額仍有不足的情況下，差額須由高捷公司及各票證公司籌措，高捷公司除了自行吸收部分費用外，於104年4月即開始與四家票證公司協商分攤金額，並以金管會公告各票證公司電子票卡於市面流通卡量及交易金額作為分攤比率參考，故高捷公司與四家票證業者均負擔部分費用，且全數用在多卡通相關功能上，絕無外傳高捷公司從中獲利及一卡通公司未出資之不實情事。
高捷公司為公共運輸事業，與四家票證公司其實為合作關係，係在各自專業領域上，分工合作，共同為持卡人提供無差別服務，而保密協議書、合作協議書、定金等，係確保彼此權利義務關係所作的必然商業作為；高捷公司始終恪遵商業協定及信守承諾，雖無法對外提供四家票證公司實際計算公式和分攤數額，但保證會抱持殷實積極態度，公平對等地推動多卡通建置。