蔡英文下午拜會日本執政黨自民黨總部。由自民黨幹事長代行（黨秘書長代理），也是前內閣官房長官細田博之、自民黨選舉對策副委員長山口泰明、自民黨幹事長代理棚橋泰文、牧原秀樹等人接待。
蔡英文曾於6年多前訪問自民黨，她表示，民進黨和自民黨都是經過再生的政黨，民進黨非常期待明年1月16日可取得中央的執政權，在國會取得更多的席次，並強化台日關係，讓台日人民都受益。
結束拜會後，蔡英文在自民黨總部1樓接受媒體採訪。被媒體問到民進黨要如何維護主權，譬如在釣魚台問題？蔡英文答說，民進黨對於釣魚台主權立場很清楚，釣魚台屬於台灣，立場沒有模糊地帶。
她認為，台日漁業協定是1個好的開始，雖有主權爭議但可坐下來，找出雙方都可互利的1種安排。她並表示，剛才沒有談及釣魚台問題，談了一下食品安全的問題。
她答覆上午到內閣府拜會的提問時說，跟一些相關的人士，（談到）對於區域和平穩定的情況，區域的經濟整合、台日之間怎麼加強經濟合作，及企業之間如何形成1個可更進一步發展貿易或商機的地方。
媒體問說：「是和部長級以上的官員（見面）嗎？」蔡英文答說：「無法回答這問題」。
蔡英文進入的官廳建築有很多部門，包括地方創生大臣石破茂的辦公室。石破茂被視為未來擔任首相呼聲高的人選。
此外，日媒猜測，蔡英文此行可能與經濟再生大臣甘利明會晤。甘利明是日本負責跨太平洋夥伴協定（TPP）事務的大臣。
談到此次訪日成果，蔡英文說，很高興與僑界、年輕學子交流。
另外，此行是首度到日本地方縣市參訪，蔡英文認為，山口縣的在地產業、歷史、文化資產、觀光、在地經濟，都做得很成功，值得進一步觀察、學習。此行拜訪日本2個主要政黨，彼此分享經驗，鼓勵、打氣。
蔡英文一行下午從東京搭機，預定今晚返抵台灣，結束為期4天的訪日之行。