根據經濟部水利署統計杜鵑颱風前後全台主要水庫共計進帳1.3億噸，已經超過一個鯉魚潭水庫的水量，包括翡翠、石門、曾文等19座水庫都持續放流中。
水利署統計9月25至29日杜鵑颱風前後全國主要水庫總計進帳1.3億噸，超過一個鯉魚潭水庫的水量，由於颱風外圍環流對台灣仍有威脅，且全台仍有局部降雨，未來水庫將持續進帳。
由於各主要水庫幾乎蓄水率都超過8、9成，包括翡翠、石門、鯉魚潭、德基、曾文、南化水庫等19座水庫，目前都在持續放流中。
至於目前一級淹水警戒有基隆市、嘉義縣、台南市；二級淹水警戒有宜蘭縣、新北市、嘉義市。
河川水位達二級警戒的則有八掌溪、急水溪及曾文溪。