因應強烈颱風杜鵑颱風可能帶來強風及豪雨，科技部新竹科學工業園區管理局於104年9月27日下午18時0分成立「園區救災及復建緊急應變中心」，局長杜啟祥請各任務編組對防颱各項工作要確實做好準備，並明確指示營建組、建管組、工商組、消防隊、清潔隊、保警中隊主管對所屬任務班隊要求全面待命戒備，迅速掌握災情並予妥善處理。
對颱風來襲時，園區可能會發生之狀況，如重要之電力、供水設施，園區周邊地區及標準廠房之積水，道路塌陷，路樹傾倒、住宅區排水系統之堵塞等，局長指示維修班、清潔隊人員事先做好下水道疏通及入水口之清理並隨時待命，並請營建組與台電公司、自來水公司防颱應變系統保持暢通機制，尤其是颱風期間廠商可能之缺水，呼籲廠商先行儲水，並對供水做好萬全準備，對於正在興建中的工程要特別注意是否淹水或崩塌，污水處理之操作亦須注意。
園區保警中隊、消防隊全員備勤，配合成立防颱救災中心，除受理報案外，並且主動對全園區廠商及住宅區宣導，作好各項防颱工作。另宜蘭、龍潭、竹南、銅鑼及新竹生醫園區加強戒備，必要時通報應變中心支援處理。竹科管理局杜鵑颱風緊急應變小組設立期間，園區內廠商如有任何災情通報或需請求支援，請多利用災情受理專線電話：(03)5772554、5785536、5785909。