海科館設有各大海洋主題展示廳、六大主題生態體驗步道，並擁有東南亞最大的IMAX 3D電影院，園區內甚至還有全台唯一的博物館車站月台。
全館更包含豐富多樣的主題館、區域探索館、IMAX3D海洋劇場，及周圍豐富的山海資源，是一座蘊藏豐富海洋知識領域與人文特色的博物館，同時也是一座室內親子旅遊的好去處。
海科館現正於特展廳展出「海陸工安幻視特展」，利用透視、錯覺原理，及人與圖的互動關係位置，達成幻視效果，特展並結合藝術名畫，經由扮演畫中的人物動作，體驗如魔術般的幻覺，民眾若購買主題館門票，還可以6折優惠加購特展門票。