針對卡式台胞證引發國人的資安疑慮，行政院長毛治國今天(25日)表示，晶片容量有限且卡片內容與紙本登載的訊息差異不大，毛治國更強調，卡式台胞證沒有衛星定位功能。毛治國說：『(原音)卡片上晶片儲存空間估計大概不超過0.1MB，沒有記錄生物特徵的資料，陸方表示是屬於一次性寫入的證件，卡式證件的晶片沒有發射訊號功能，不具有衛星定位功能，所以目前應該不具有追蹤使用人的能力。』
毛治國表示，政府會持續關注卡式台胞證的執行狀況與後續發展，同時也認為兩岸事務交流，務必要強化事前的溝通與聯繫。毛治國說：『(原音)考量未來科技日新月異，政府仍將密切關注卡式證件的執行狀況跟後續發展。第二，未來陸方在處理兩岸往來重大議題時，我方認為務必強化雙方事前聯繫溝通，避免再次發生類似情形。』
毛治國表示，大陸單方面的作為並不會改變兩岸關係，且根據中華民國憲法主張的兩岸關係定位，以及維持現狀的民意趨勢與政策立場，政府不會因為大陸單方面作為而有改變；他強調，政府主張兩岸互不承認主權、互不否認治權的立場從未改變。