壽山動物園受限於環境腹地和經費因素，動物種類有限，不過近年朝可愛動物型態經營，每年有逾百萬入園數。
高市府有規劃充實園區動物，但是受限於國際動物保育的規定，很多動物根本無法取得，只能透過和台北木柵動物園或民營野生動物園交流，但是要齊備基本的動物種類仍然有難度，例如長頸鹿就一直無法引進。
透過兩岸交流，壽山動物園近來和四川成都動物園取得共識，將以2對台灣梅花鹿交換2對小貓熊。
壽山原本也有小貓熊但是年事高已經往生，經與成都動物園協調，同意互換的方式，充實展示動物；園方以過去引進白老虎的經驗，評估繁瑣的認證流程，至少要2年時間。
市府考量壽山動物園有限的發展空間，已另覓在內門區擴建，不過評估龐大的遷建費，可能採民間投資方式辦理，結合遊樂設施，以增加遊憩的多元性。