番茄營養價值極高，在鮮食及食品加工業上需求非常大，全世界番茄栽培面積高達473餘萬公頃，被列為全世界產量最高的30種作物之一，推估種子需求量年需約1060公噸，種子售價約新台幣0.5元/粒(不抗病)或1.5 ~ 3元/粒(抗病)，種子(苗)產值非常龐大。
番茄栽培過程中包含種子及種苗均易遭受病蟲危害，嚴重影響定植後產量與品質。常見病害有，番茄黃化捲葉病毒(TYLCV)、番茄斑點萎凋病毒(TSWV)、番茄嵌紋病毒(ToMV)、晚疫病(Phytophthora infestans)、萎凋病(Fusarium oxysporum)、黃萎病(Verticillium dahliae)、青枯病(Ralstonia solanacearum)、細菌性斑點病(Pseudomonas syringae)、根瘤線蟲(Meloidogyne spp.)等。由於農藥過度使用、環保意識抬頭，育成抗病品種為確保產量與品質最有效防治方式之一，各國番茄種子公司對抗病品種需求相當殷切，此亦為抗病品種優勢。
如何在眾多種子(苗)中篩選抗病品種?可利用近年開發成熟的DNA檢測技術(即分子標誌輔助育種技術)，其優點為：可早期(幼苗階段)鑑定作物抗病基因及基因型(R/R、R/S、S/S)，加速育成抗病品種並提升國產抗病品種國際競爭力，成果非常顯著。本場於農委會經費協助下已開發完成番茄抗黃化捲葉病毒基因(Ty1, Ty2, Ty3, Ty5)、抗斑點萎凋病毒基因(Sw5)、抗嵌紋病毒基因(Tm1, Tm2, Tm22)、抗萎凋病基因(I1, I2, I3)、抗晚疫病基因(Ph2, Ph3)、抗黃萎病(Ve1, Ve2)、抗葉霉病(Cf5, Cf9)、抗根連線蟲基因(Mi1)等簡易DNA檢測技術，相關技術已(或將)技術移轉給國內番茄育種業者，並實際應用於篩選具優良健壯番茄品種，縮短育種時程，大幅提升國產番茄品種國際競爭力。