台灣離島馬祖除了戰地遺跡，最大的色特就是原始的生態風貌，在海上閃閃發光的藍眼淚和復育成功的神話之鳥－黑嘴端鳳頭燕鷗也成了近年來國內外觀光客必朝聖的重點。
馬祖風景管理處統計，今年1到7月份已吸引8萬遊客造訪馬祖，今年底總共可望吸引12萬人次，扣除中國大陸遊客，國外觀光客約有400人，比去年的297人增加100多人，年底前可望達到500人，可說是近倍數成長。
國外觀光客以香港遊客最多，星馬、澳洲、日本遊客也有增加趨勢。至於陸客方面，觀光局長謝謂君說，各離島都提出要求，希望陸客小三通配額可以從每天的500名增加至1000名，觀光局計畫在年底前調整措施，讓離島有更多利多。
除了開放對陸客限制，謝謂君補充，將放寬東南亞簽證規定，未來印尼、菲律賓、泰國、越南、印度旅客來台，只要透過當地優質旅行社招攬團客，不需提出應備文件與面談，就可審核，縮短送辦時程，預計年底前可上路，旅客人數約成長8%。