馬總統3日投書媒體，除了批評前總統李登輝日前說釣魚台是日本的等言論失言，應該道歉外，也從歷史、地理、地質乃至於國際法等4個層面，詳細說明釣魚台主權當然歸屬於中華民國。
而副總統吳敦義3日在出席活動前，被問及相關問題，他也表示不同認同李登輝的說法，他強調釣魚台當然是中華民國、是台灣的，這是無庸置疑的事情。吳敦義：『(原音)本來釣魚台就是中華民國的領土，而且編在台灣省宜蘭縣頭城鎮大溪里，這是千真萬確；從1895年割讓出去給日本以後，在1945年我們對日抗戰勝利就依照開羅宣言、波茨坦公告乃至於中日和約都已經明白表示，而且已經納入我國版圖。等於光復台灣的時候就同時光復了釣魚台，這是無庸置疑的事情。』
至於有傳言指出，國民黨總統參選人洪秀柱民調不見起色，國民黨有可能以吳敦義取代洪秀柱，所謂「洪下吳上」的說法，吳敦義則並未對此回應。