中國國民黨下午舉行中常會，邀衛福部次長林奏延專案報告，據衛福部書面報告指出，目前每天主動聯繫醫療院所，了解並提供需求物資；協調國內廠商優先加速生產並提高產能；向國外緊急採購，以專案方式進口；開設捐贈管道，媒合供需，有效分配物資。
衛福部也透過健保署單一窗口，每日更新傷患情形並監測醫院人力需求，由台北區緊急醫療應變中心（EOC）協助及時調度支援；隨時監測醫療資源情形，避免排擠影響其他病患就醫權益；研擬中長期醫療照護計畫，以因應穩定患者之轉診與長期治療需求。
至於傷者出院前後心理關懷追蹤，衛福部表示，由醫院心理專業人員對於傷者家屬提供哀傷輔導；對於出院者於出院前進行心理評估，並通知衛生局，由社區心理衛生中心派員進行後續社區關懷訪視，以免產生創傷後壓力疾患。
追蹤關懷時間至少3個月，重傷需長期復健個案視需要延長至6個月或1年。
此次事件健保給付醫療費用，不列入健保總額並從寬辦理。
衛福部指出，從104年6月27日至104年9月30日止健保不給付的自費醫療費用，包括部分負擔、病房差額、燒燙傷自費醫材、處置費用及救護車費用，不向病人收費，由健保署先行墊付後，再由新北市政府專案返還墊付金額。
至於中華民國醫師公會全國聯合會將與日本醫師會簽署雙方緊急災難醫護人員支援備忘錄，仍須遵循當地國法令規定，由具合法醫師資格者提供診斷、處方、手術及麻醉等醫療服務，而外籍醫護人員則可在當地醫師指導監督下從事核心醫療、護理以外的輔助醫療、護理等周邊作業。