八仙爆炸意外成為新北市有史以來規模最大的災害，新北市長朱立倫多次向中央喊話，要求衛福部統籌調度全國醫療資源。
對此，衛福部長蔣丙煌表示，衛福部會一肩扛起責任，絕不迴避。他說：『(原音)衛福部這個事情我們絕對是一肩扛起所有的責任，也就是我們該做的事情我們絕對做，不會迴避。事實上，第一時間我們就開始啟動EOC，在禮拜天的凌晨2點左右，基本上，所有的病人已經從急診收治到病房，我們覺得這個已經是滿快的。』
衛福部醫事司司長王宗曦表示，事件發生後，緊急醫療應變中心(EOC)就立刻啟動，通知轄區內的急救責任醫院準備收治病人，同時召回醫護人員待命，由於當時救護車不足，新北、台北、基隆與桃園的救護車都被調度支援。