對於八仙樂園塵爆意外，外科醫師出身的台北市長柯文哲29日表示，他對台灣的醫療很有信心，只是這次病例突然且太多，是否超過容量，還要討論。他並指出，現在有比較嚴重的病人會陸續轉到台大醫院，不可否認將對台大醫院造成排擠效應，他認為如果不是急診刀，可以先暫停，把空間留給燒傷的重症病人，尤其燒傷後頭3天，感染會是最大的問題。
柯文哲並指出，雙北是共同生活圈，卻有兩套行政體系，使得救護車後送的情況比較混亂，因此，他認為雙北的救護系統應該整合，才會更有效率。柯文哲：『(原音)救護車有台北市跟新北都跑去那裡，但病人要載去哪家醫院就沒有整合，這變成需要去建立。這種事情就這樣，沒有遇到，大家都不會想到；以前一個個CASE都有系統可以解決，一下幾百人，分配系統要怎麼很迅速送到該送的醫院，有很清楚直接送到該送的醫院，不會出現今天的局面。』
柯文哲也表示，雖然這起意外發生在新北市，但他和新北市長朱立倫於公、於私都是老朋友，更何況這是救命的事情，所以他於第一時間就在台北市府的群組中下令，要把此事當成台北市自己的事情處理，一定會和新北市合作救援。