林燕祝指出，飛雁新村更新主管機關為台南市政府，預估開發時程至少要10年，市長賴清德任期屆滿時，可能只到取得建照，如果發生爭議，未來市長對政策轉變性，所衍生的問題需未雨綢繆。
林燕祝認為，開發案應以台南市政府名義和遠雄簽約，後續相關權利義務執行不致有脫節之虞，土地權屬管理機關國防部在價金給付、土地交付、歷史建築等相關作業，處理過程流於草率，有待明確規範，而案對原眷戶權益如何保障也未載明，均需注意改進。
由於開發基地將興 建10棟大樓，每棟23至28樓，實施開發收入高達115億元以上，遠雄取得土地共需取得支付約21億元，僅占1/5成本，她問市府估價標準為何，是否賤賣市產。
林燕祝認為招標及簽約機關存有瑕疪，主張由議會行文給公共工程委員會，就簽約機關適當性說明；至於外傳遠雄打通關節疑雲，則由會議主席裁示送請檢調單位進行了解，還議員們清白。