有關MERS-CoV（中東呼吸症候群冠狀病毒感染症）防疫工作，朱立倫指出，市府記取SARS的教訓，韓國爆發第一例確診案例後，即判斷情勢嚴峻，副市長侯友宜並於4日召開跨局處應變會議，指示市府各機關、學校、社區等全體動員，共同防疫。
另外，衛生局督導第一線防疫人員落實各項防疫措施，除檢查設備及標準作業流程，也實施抽查，確保醫院提高警覺，另因應防疫工作，醫療院所於週末假日也開始輪班或停休。朱立倫強調，市府會將防疫作為透過網路及新聞稿發布，隨時更新，使民眾安心。
衛生局長林奇宏說，防疫工作需分階段進行，除落實醫院例行性感染管控作業，目前最重要的是掌握旅遊史與接觸史，新北市已備妥2萬5000多個N95口罩、10家隔離醫院及80個負壓隔離病床，全體動員積極投入防疫工作。