總統府晚間表示，為因應近來韓國爆發的MERS疫情，深入檢視目前政府因應MERS疫情的防疫策略，確實掌握機先、杜絕疫情，維護國人健康及國家安全，馬總統今天召開「因應MERS疫情國安高層會議」，毛治國率衛福部、疾管署、外交部、內政部、移民署、警政署、交通部、民航局、觀光局、國防部、教育部、陸委會、退輔會及海巡署等相關部會首長參加。
各部會就近期政府加強防疫作為進行報告。總統府晚間發布新聞稿指出，衛福部與疾管署於韓國5月21日發生首例疫情後，22日即成立因應小組嚴密監控掌握疫情發展，強化各項防疫策略及措施，建立網站專區加強國人防疫衛教及提供透明疫情資訊。
馬總統與毛治國隨即指示政府各相關單位加強各項防疫作為，務必強化「邊境檢疫、院感管制、國際合作、風險溝通」等因應作為，嚴密監控疫情發展，必要時將成立中央流行疫情指揮中心。
衛福部指出，國內自2009年起參與WHO IHR Focal Point運作體系，已可取得WHO即時疫情監測資訊，有效強化國內防疫預警能力，政府並與各國防疫單位建立直接聯絡管道分享即時資訊。
加強邊境管制作為方面，疾管署表示，已將國人赴韓國首爾（含京畿道）之旅遊疫情建議調高為「第二級：警示（alert）」，並修訂通報病例定義，納入「首爾醫院出入史」，並針對韓國入境航班進行廣播宣導，入境旅客全面發放健康管理須知，必要時進行登機檢疫。
此外，也加強宣導電話「1922」之24小時全年無休的防疫專線。全國指定134家隔離醫院，其中6家為網區應變醫院，6家為支援合作醫院。外交部也將國人赴韓國首爾（含京畿道）之旅遊警示調高至「黃色警示」。
總統府說，內政部移民署與警政署已配合衛福部與相關機關，加強機場、港口等邊境控管措施，落實執行詳實填繳入國登記表，並與疾管署建立聯繫窗口，以在疫情需要時，即時提供疾管署追蹤旅客在台聯絡資訊與入出境管制作為。
交通部表示，已加強海、空、陸運及觀光的防疫作為，於所轄各機場、港口與配合疾管署實施入境旅客體溫量測篩檢。並於台北、台中及高雄航站進行每日定時消毒，針對南韓班機入境動線進行全面消毒。
教育部則加強台灣留韓學生防疫工作，提供口罩索取，提醒最新訊息與緊急聯絡電話，並針對7月3日至14日於韓國光州舉行世大運，擬定防疫工作與因應措施。
馬總統也在聽取報告後作出4點裁示，包括請行政院密切掌握疫情發展，適時提高指揮層級、請衛福部統一研擬防疫計畫，提前部署及盤點各項防疫資源、請行政院強化國際合作、秉持「料敵從寬、禦敵從嚴」防疫鐵律。