MERS-CoV（中東呼吸症候群冠狀病毒感染症），又稱新SARS。金門縣衛生局表示，雖然國內尚無疫情，但因金門縣與大陸地區鄰近，而且小三通交流頻繁，只有民眾配合做好相關防護措施，才能有效防堵疫情於境外。
此外，由於回教齋戒月17日到7月17日展開，加上暑假將到，衛生局呼籲計劃前往流行地區的民眾，應避免到通風不良場所，注意呼吸道防護並勤洗手，同時避免騎乘或接觸駱駝，也不要生飲駱駝等動物奶；返國時若出現發燒、類流感、腹瀉等症狀，應主動告知機場港口檢疫人員，儘速就醫。
因應疫情，衛生局表示，縣內各項防疫物資已充分儲備，並將與疾管署台北區管制中心金門辦事處維持緊密聯繫，隨時嚴密監控小三通入境發燒旅客後續電訪追蹤與健康監測。
衛生局也函請縣內應變醫院及各醫療院所提高警覺，加強就診病患的接觸史及旅遊史等，落實院所內感染管制相關措施與稽查。此外，還將巡迴社區和校園辦理衛教宣導，以及醫護人員教育訓練，提升民眾防範認知，增進醫護工作者自我防護能力。