該局說明，個人於計算證券交易損益時，102年1月1日以後買進(取得)股票之成本必須以加權平均法計算，同一申報戶之個人應個別計算其證券交易所得或損失，且個人103年度之證券交易損失，只能自其本身103年度證券交易所得中減除，減除後之餘額如為負數者，其所得額以0元計算，另個人倘持有股票滿1年以上者，得以其股票交易所得之半數作為當年度所得額，並應以先進先出法認定持有股票是否滿1年以上。
該局進一步說明，個人投資應課稅之股票如買賣交易次數頻繁，在計算股票加權平均成本及認定是否持股滿一年時，計算過程較繁雜，為節省民眾計算時間，該局特別設計「證券交易所得試算程式」，只要輸入交易資料，程式會自動計算證券交易所得及應納稅額，該程式已置於該局網站（網址︰http://www.ntbt.gov.tw）/熱門焦點/證交所得課稅專區，歡迎民眾自行下載使用。該局呼籲，民眾103年度如有股票交易，今年於辦理103年度綜合所得稅結算申報時，記得確認該等股票交易所得是否符合課稅要件，正確計算所得辦理申報，以免短漏報遭補稅並裁處罰鍰。