國發會推動離島建設發展，推出4年一期的離島綜合建設實施方案，透過基礎建設、歷史文化保存和生態保育等措施，活絡離島經濟發展。
離島建設基金從2001年到2010年每年編列新台幣30億元的經費，已經編足300億元的離島基金，目前餘額68億元，未來不再繼續編列，將秉持公務預算優先、離島基金為輔的原則，延長基金使用年限，永續經營。國發會副主委黃萬翔說：『(原音)另外就是在建設過程中，透過外部效益內部化，讓建設加值，挹注自己的基金，離島建設雖然還有68億，但慢慢增長收入，讓他永續循環。』
根據國發會的報告，近年推動離島建設後，旅遊人次大幅成長，由2000年的130萬人次提升到去年486萬人次；金馬地區失業率也逐年下降。
行政院長毛治國則表示，相關部會應編列預算，協助離島建設發揮加成作用，也應注意旅客人數、水電等總量管制，確保旅遊品質。