台北市廉政委員會調查大巨蛋案，外界質疑是「黑機關」，台北市長柯文哲9日表示，在郝市府時代叫「肅貪中心」，現在只是把招牌換一換，補了一些作業規則，「還是在政風處裡面」。
前台北市長郝龍斌昨透過臉書發文痛批，「對於柯市長利用其自設、體制外、無法定職權的黑機關，在未經過任何嚴謹程序的調查下，對本人及團隊同仁的誣衊，我們絕不接受！」
他指出，事實上，廉政委員之背景、專業素養，沒有足夠的社會公信力；其中多位具有明顯政治傾向及政黨背景，其取得政府機密資料後，更多次出現濫用資料誹謗他人名譽之違法行為。
郝龍斌表示，部分廉政委員藉由其取得之資料，利用政論節目，散播片面、曲解之資料，提升個人知名度，取得利益。各種光怪陸離作為，更已脫離政府機關之正當作為。「致使所謂的廉政調查，已成為柯市長及廉政委員各式鬥爭或新聞炒作之工具」。
他也意在言外表示，「除了利用黑機關之廉委會，柯市長之市長顧問，是否利用其職權調閱機密質料，私下提供特定媒體、名嘴？其目的何在？是否違反公文相關規定？是否柯市長授意？亦應接受檢驗。」
郝龍斌抨擊，自柯市長上任以來，未見任何市政建設與願景提出，僅屢屢藉由廉政委員擔任政治鬥爭打手，炒作新聞，抹黑他人、塑造個人形象。柯市長所謂的「五大案」多已經過司法機關、檢調及監察院調查，甚至連柯市府的法務局局長都公開承認「合法」，「柯市府卻利用具有明顯政黨色彩、欠缺公正性的廉委會黑機關，進行政治鬥爭，令人不恥！我及團隊同仁將訴諸司法，以證清白！」
針對廉政會是「黑機關」的質疑，柯文哲今受訪表示，在郝市府時代好像叫「肅貪中心」，現在只是把招牌換一換，補了一些作業規則，從以前就留下來的，但有幾個特色，府外委員比較多，以前是市長指定的比較多，所以人家才會說沒效，「還是在政風處裡面」。